氯消毒的作用原理是：氯氣或氯制劑通過水解形成次氯酸，次氯酸再進一步分解形成新生態氧[O]，新生態氧的極強氧化性使菌體和病毒上的蛋白質等物質變性，從而致死病源微生物。次氯酸在殺菌、殺病毒過程中，不僅可作用于細胞壁、病毒外殼，而且因次氯酸分子小，不帶電荷，還可滲透入菌（病毒）體內，與菌（病毒）體蛋白、核酸、和酶等有機高分子發生氧化反應，從而殺死病原微生物。同時，次氯酸產生出的氯離子還能顯著改變細菌和病毒體的滲透壓，使其細胞喪失活性而死亡。

游泳池的消毒劑必須具備以下特點：一是對人身不造成危害；二是消毒作用產生要快；三是消毒作用持續要長；四是氧化作用要大；五是水中不遺留色度和污泥；六是投藥設備安全、方便、耐用，造價低；七是價格低廉。

綜合考慮，二氧化氯、次氯酸鈉都是最佳選擇。次氯酸鈉投加設備價格低廉，運行費用低，但在消毒過程中，容易與池水中的有機物反應生成微量致癌的鹵化物。相比較，二氧化氯在消毒的過程中，不會產生致癌物質，而且消毒效果較好，只不過泳池設備投資成本稍高。因而在有條件的情況下，建議采用二氧化氯消毒。